“根”，又称“暗部培训部门”，由志村团藏建立并指挥的一个神秘组织。
根组织比暗部隐藏得更深，所做的事也更加见不得光。三代火影默许了这些。团藏和根成为了木叶最直接有效的利剑，以“宁错杀，不放过”的姿态铲除村内外一切威胁。
根组织的日渐壮大也助长了团藏的野心，在团藏没有做出过激举动之前，三代一直默认根的存在，应该无论在什么时候都有一些需要使用特殊手段的脏事要处理，而三代作为木叶村最崇高的人物，有些事自然不好亲自出马，于是他同样在利用根帮自己处理政务。
但三代也是有底线的人，对于火之意识的继承者来说，最想保护、同时最不能失去的，就是代表木叶村未来的孩子！团藏的行为已经触犯了三代的底线，现在的他已经不是当初那个平易近人的和善火影了，此时的他面露杀意，在依然没有得到苍介安全的信息后，三代冷冰冰地对身后的铃木说道：
“铃木，将这道命令火速传递给期末卡卡西……”
画面一转，在根组织的地下室内，苍介依然和黑衣人对峙着；看着对方的态度丝毫没有回旋的余地，加之伤口的剧烈疼痛，苍介的内心无比的愤怒！
“臭小子，尝尝抽筋断骨的滋味吧！”
就当黑衣人想要进一步打断苍介的手脚时，一股刺眼的血红光芒照进了他的双眼！
“写轮眼：腥红月——诛心！”
随着苍介大吼一声，血红的光芒瞬间照亮了整个房间，空气中充斥着丝丝不易察觉的血腥味，黑衣人褐色的拳头突然停了下来，整个不可思议地看着苍介！
“我本……无意杀人……尔等若是欺人太甚……我必将尔等血流成河！”
黑衣人双眼睁得老大，整个人像是进入了一种精神错乱的状态，手上也没有力气继续拎着苍介，而是如同一具尸体一样，重重地倒在了地上。
黑衣人死都不会相信：他竟然会死在一个乳臭未干的宇智波小鬼手里，
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